記者于近日在哈爾濱市召開的“國際首例豬T2T全基因組組裝——民豬完整基因組構建”成果發(fā)布會上獲悉，由國內5個科研團隊基于三代測序、ONT、Hi-C等前沿技術完成的豬T2T全基因組組裝——民豬完整基因組構建成果，填補了豬T2T基因組組裝領域的空白，為豬遺傳育種和功能基因挖掘提供了高精度“藍圖”，標志著豬基因組研究邁入“完整解析”新時代，成果達到國際領先水平。
這5個團隊包括中國農業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所張龍超研究員團隊、黑龍江省農業(yè)科學院畜牧研究所劉娣研究員團隊、重慶市畜牧科學院王金勇研究員團隊、岳麓山實驗室印遇龍院士團隊和四川農業(yè)大學李明洲教授團隊。發(fā)布會上，劉娣代表5個團隊進行了成果發(fā)布。專家組經過集中討論，最后提出綜合評價結論。大家一致認為，該成果不僅實現(xiàn)了豬基因組研究的里程碑式突破，更在應用層面展現(xiàn)出多重優(yōu)勢：在基因組完整性方面為豬遺傳多樣性研究、進化分析及疾病抗性基因挖掘提供完整參考；SV標記的應用顯著提升基因組選擇的效率，加速優(yōu)良性狀定向改良，實現(xiàn)精準育種；冷適應基因的發(fā)現(xiàn)為環(huán)境適應性育種開辟新路徑，助力養(yǎng)殖業(yè)提質增效，提高產業(yè)適配性。
劉娣介紹，這一研究成果有四大特點。一是基因組最完整，填補了國際空白。二是泛基因組最全面。三是發(fā)現(xiàn)了89個與冷適應相關的候選基因，通過整合SV與RNA測序分析，進一步鎖定17個與結構變異直接關聯(lián)的冷適應基因。四是育種應用方面取得新突破，育種準確度顯著提升。此外，團隊通過精細定位發(fā)現(xiàn)調控豬體型的關鍵基因組區(qū)域CL3及核心SV位點，為高效選育優(yōu)質種豬提供了新策略。
中國工程院院士、中國科學院亞熱帶農業(yè)生態(tài)研究所研究員印遇龍認為，用傳統(tǒng)技術育種至少要經過5個世代，應用新技術后，可以縮短育種進程。這一成果對指導豬的生物育種，尤其是地方豬的生物育種具有非常重要的意義。